1480 yılının bahar aylarından birinde dünyaya geldiği bilinen Macellan ilk deniz yolculuğuna daha 25 yaşındayken çıkmıştır. Bu yolculukta görevi ise Francisco de Almeida’yı Hindistan’a ulaştırmaktı. Görev esnasında Portekiz genel valisi idi. Yerel bir kralın vergi aldığı halde Almeida’yı vermeyi reddetmesi üzerine Macellan, ilk savaşını da görmüş oldu. Almeida günümüzde Tanzanya olarak bilinen bölgeyi ele geçirdi. 

1506 yılında Macellan Doğu Hindistan’a gitti. Burada Baharat Adalarını keşfetti. 1509 yılının şubat ayında Diu Muhaberesi’ne katıldı. Bu muhabere Osmanlı devletinin bölgedeki gücünü yitirdiğini gösteriyordu. 1510 yılında kaptanlık görevine getirilen Macellan, bir sene içerisinde doğuya izinsiz gemi götürdü. Bu hareketinin sonucunda ise kaptanlık görevini kaybetti. Portekiz’e yeniden dönmesi için kendisine zorlamalarda bulunuldu. 

1511 yılında Fas’a gönderilerek Amazon Savaşına katılması istendi. Savaş devam ederken dizinden aldığı yara sebebiyle savaş meydanından izinsiz bir şekilde ayrıldı. Bu olay ile birlikte Almedia’nın gözünden düştü. Aynı zamanlarda Emeviler ile yasalara uygun olmayan ticaretler gerçekleştirmekle suçlandı. Suçlamaların etkisi zaman içerisinde azalmış olsa da Portekiz kralı 1. Manuel, Macelln’ın ücretini arttırmayı reddetti. Ayrıca 1514 tarihinden itibaren yeni bir işin kendisine verilmeyeceği söylendi. Bu durum karşısında Macellan çareyi hizmetlerini İspanya Krallığına sunmakta buldu. 

10 Ağustos 1519 tarihinde Macellan ve beş gemi Sevilla’dan ayrılarak Sanlucar de Barrameda’ya vardı. Bu yolculuk dünya turunun başlangıcı oldu. Macellan’ın gerçekleştirdiği keşif gezisi, dünya çevresinde yapılan ilk seyahat olarak kabul edilir. Ayrıca Güney Amerika’da bulunan Boğaz geçilerek Atlas okyanusu ve Büyük okyanusun birleştiği noktada yapılan ilk seferdir. Bu yolculuklar esnasında Macellan ve ekibi Avrupa İçin yeni olan hayvan türleri ile de karşılaştı. Bu türler hörgüçsüz develer olarak adlandırılan lamalar ve penguenlerdir. 

Güney yarım kürede Macellan Bulutsuları keşfedildi. Bulutsular, en yakın iki galaksidir. Ayrıca Macellan tarafından gerçekleştirilen keşif gezileri sayesinde dünyanın çevresi de öğrenildi. Yapılan yolculuklar uluslararası saat sisteminin olması gerektiğini düşündürdü. Çünkü yolcuklar sonlandığında seyir defterlerindeki günler ile geride kalan günler arasında bir uyumsuzluk söz konusuydu. Özel bir heyet hazırlıklara başladı ve bu sorunu papaya iletti. Denizcilik alanında çeşitli hizmetler verdikten sonra Macellan 1521 senesinde vefat etti.